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@datagrok/bio @2.27.3

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Bioinformatics support (import/export of sequences, conversion, visualization, analysis). [See more](https://github.com/datagrok-ai/public/blob/master/packages/Bio/README.md) for details.

Maintainers

aparamonov_datagrokskalkindrizhinappolovyi_datagrokaleksashka_11

Dependencies (23)

PackageConstraintRegistry Status
wu ^2.1.0 auto_approved
ajv ^8.12.0 auto_approved
rxjs ^6.5.5 auto_approved
dayjs ^1.11.4 auto_approved
immunum ^1.1.0 auto_approved
umap-js ^1.3.3 auto_approved
cash-dom ^8.0.0 auto_approved
ajv-errors ^3.0.0 auto_approved
css-loader ^6.7.3 auto_approved
file-loader ^6.2.0 auto_approved
openchemlib ^7.2.3 No greenflagged match
datagrok-api ^1.26.3 auto_approved
style-loader ^3.3.1 auto_approved
@webgpu/types ^0.1.40 auto_approved
@biowasm/aioli ^3.1.0 No greenflagged match
fastest-levenshtein ^1.0.16 auto_approved
@datagrok-libraries/ml ^6.10.11 auto_approved
@datagrok-libraries/bio ^5.63.7 auto_approved
@datagrok-libraries/math ^1.2.6 auto_approved
@datagrok-libraries/test ^1.1.0 auto_approved
@datagrok-libraries/utils ^4.7.2 auto_approved
@datagrok-libraries/chem-meta ^1.2.9 auto_approved
@datagrok-libraries/tutorials ^1.7.4 auto_approved

Dev Dependencies (21)

PackageConstraintRegistry Status
eslint ^8.57.1 auto_approved
webpack ^5.105.2 auto_approved
@types/wu ^2.1.44 auto_approved
ts-loader ^9.5.1 auto_approved
typescript ^5.5.3 auto_approved
@types/node ^17.0.24 auto_approved
webpack-cli ^5.1.4 No greenflagged match
@datagrok/eda ^1.4.13 Not imported
@datagrok/chem ^1.17.1 auto_approved
@datagrok/helm ^2.13.1 auto_approved
datagrok-tools ^5.1.9 auto_approved
source-map-loader ^5.0.0 auto_approved
@datagrok/peptides ^1.27.4 Not imported
eslint-plugin-rxjs ^5.0.3 auto_approved
@datagrok/dendrogram ^1.4.11 Not imported
eslint-config-google ^0.14.0 auto_approved
webpack-bundle-analyzer ^4.10.2 auto_approved
@typescript-eslint/parser ^8.8.1 auto_approved
@datagrok-libraries/js-draw-lite ^0.0.10 Not imported
@typescript-eslint/eslint-plugin ^8.8.1 auto_approved
@datagrok-libraries/helm-web-editor ^1.1.16 No greenflagged match

Transitive Dependency Tree

219 transitive deps max depth 10
  ├─ @biowasm/aioli ^3.1.0
  ├─ @datagrok-libraries/bio ^5.63.7 → 5.65.1
  ├─ @datagrok-libraries/chem-meta ^1.2.9 → 1.2.12
  ├─ @datagrok-libraries/math ^1.2.6 → 1.2.7
  ├─ @datagrok-libraries/ml ^6.10.11 → 6.10.13
  ├─ @datagrok-libraries/test ^1.1.0 → 1.2.2
  ├─ @datagrok-libraries/tutorials ^1.7.4 → 1.7.7
  ├─ @datagrok-libraries/utils ^4.7.2 → 4.7.2
  ├─ @webgpu/types ^0.1.40 → 0.1.69
  ├─ ajv ^8.12.0 → 8.20.0
  ├─ ajv-errors ^3.0.0 → 3.0.0
  ├─ cash-dom ^8.0.0 → 8.1.5
  ├─ css-loader ^6.7.3 → 6.11.0
  ├─ datagrok-api ^1.26.3 → 1.27.6
  ├─ dayjs ^1.11.4 → 1.11.21
  ├─ fastest-levenshtein ^1.0.16 → 1.0.16
  ├─ file-loader ^6.2.0 → 6.2.0
  ├─ immunum ^1.1.0 → 1.1.2
  ├─ openchemlib ^7.2.3
  ├─ rxjs ^6.5.5 → 6.6.7
  ├─ style-loader ^3.3.1 → 3.3.4
  ├─ umap-js ^1.3.3 → 1.4.0
├─ wu ^2.1.0 → 2.1.0
  ├─ @babel/core ^7.27.1 → 7.29.7
  ├─ @datagrok-libraries/chem-meta ^1.0.12 → 1.2.12
  ├─ @datagrok-libraries/chem-meta ^1.2.7 → 1.2.12
  ├─ @datagrok-libraries/compute-utils ^1.44.9 → 1.46.2
  ├─ @datagrok-libraries/gridext ^1.4.0 → 1.5.4
  ├─ @datagrok-libraries/math ^1.2.6 → 1.2.7
  ├─ @datagrok-libraries/ml ^6.7.6 → 6.10.13
  ├─ @datagrok-libraries/utils ^4.5.7 → 4.7.5
  ├─ @datagrok-libraries/utils ^4.5.7 → 4.7.2
  ├─ @deck.gl/core 8.8.12
  ├─ @keckelt/tsne ^1.0.2 → 1.0.2
  ├─ @types/react ^18.3.11 → 18.3.31
  ├─ @types/seedrandom ^3.0.8 → 3.0.8
  ├─ @types/wu ^2.1.44 → 2.1.44
  ├─ @webgpu/types ^0.1.40 → 0.1.69
  ├─ @webgpu/types ^0.1.40 → 0.1.70
  ├─ cash-dom ^8.1.4 → 8.1.5
  ├─ cash-dom ^8.1.1 → 8.1.5
  ├─ cash-dom ^8.1.5 → 8.1.5
  ├─ datagrok-api ^1.25.0 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.26.0 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.21.1 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.27.0 → 1.27.6
  ├─ dayjs 1.11.19 → 1.11.19
  ├─ dayjs =1.11.10
  ├─ dayjs ^1.11.10 → 1.11.21
  ├─ dayjs ^1.11.13 → 1.11.21
  ├─ fast-deep-equal ^3.1.3 → 3.1.3
  ├─ fast-sha256 ^1.3.0 → 1.3.0
  ├─ fast-uri ^3.0.1 → 3.1.2
  ├─ fastest-levenshtein ^1.0.16 → 1.0.16
  ├─ fastest-levenshtein ^1.0.12 → 1.0.16
  ├─ file-loader ^6.2.0 → 6.2.0
  ├─ graphology ^0.25.4
  ├─ graphology-layout-forceatlas2 ^0.10.1 → 0.10.1
  ├─ icss-utils ^5.1.0 → 5.1.0
  ├─ jaro-winkler-typescript ^1.0.1 → 1.0.1
  ├─ js-base64 ^3.7.5 → 3.7.8
  ├─ json-schema-traverse ^1.0.0 → 1.0.0
  ├─ loader-utils ^2.0.0 → 2.0.4
  ├─ lru-cache ^10.4.3 → 10.4.3
  ├─ mjolnir.js ^2.7.0
  ├─ ml-levenberg-marquardt ^4.1.3
  ├─ ml-levenberg-marquardt ^2.0.0
  ├─ openchemlib ^7.2.3
  ├─ postcss ^8.4.33 → 8.5.15
  ├─ postcss-modules-extract-imports ^3.1.0 → 3.1.0
  ├─ postcss-modules-local-by-default ^4.0.5 → 4.2.0
  ├─ postcss-modules-scope ^3.2.0 → 3.2.1
  ├─ postcss-modules-values ^4.0.0 → 4.0.0
  ├─ postcss-value-parser ^4.2.0 → 4.2.0
  ├─ react ^18.3.1 → 18.3.1
  ├─ require-from-string ^2.0.2 → 2.0.2
  ├─ rxjs 6.6.7 → 6.6.7
  ├─ rxjs ^6.6.7 → 6.6.7
  ├─ rxjs ^6.5.5 → 6.6.7
  ├─ schema-utils ^3.0.0 → 3.3.0
  ├─ seedrandom ^3.0.5 → 3.0.5
  ├─ semver ^7.5.4 → 7.8.2
  ├─ source-map-loader ^4.0.1 → 4.0.2
  ├─ tslib ^1.9.0 → 1.14.1
  ├─ typeahead-standalone 4.14.1 → 4.14.1
  ├─ umap-js ^1.3.3 → 1.4.0
  ├─ uuid ^9.0.1 → 9.0.1
  ├─ worker-loader ^3.0.8 → 3.0.8
  ├─ ws ^8.18.2 → 8.21.0
├─ wu ^2.1.0 → 2.1.0
  ├─ @babel/code-frame ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/core ^7.27.1 → 7.29.7
  ├─ @babel/generator ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-compilation-targets ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-module-transforms ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helpers ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/parser ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/template ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/traverse ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/types ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @datagrok-libraries/arrow ^1.1.0 → 1.1.0
  ├─ @datagrok-libraries/chem-meta ^1.0.12 → 1.2.12
  ├─ @datagrok-libraries/math ^1.2.6 → 1.2.7
  ├─ @datagrok-libraries/utils ^4.5.7 → 4.7.5
  ├─ @datagrok-libraries/utils ^4.7.0 → 4.7.5
  ├─ @jridgewell/remapping ^2.3.5 → 2.3.5
  ├─ @keckelt/tsne ^1.0.2 → 1.0.2
  ├─ @types/json-schema ^7.0.8 → 7.0.15
  ├─ @types/lodash.clonedeepwith ^4.5.9 → 4.5.9
  ├─ @types/node ^14.14.37 → 14.18.63
  ├─ @types/prop-types * → 15.7.15
  ├─ @types/react ^18.3.11 → 18.3.31
  ├─ @types/seedrandom ^3.0.8 → 3.0.8
  ├─ @types/uuid ^10.0.0 → 10.0.0
  ├─ @types/wu ^2.1.44 → 2.1.44
  ├─ @webgpu/types ^0.1.40 → 0.1.70
  ├─ @webgpu/types ^0.1.40 → 0.1.69
  ├─ ajv ^6.12.5 → 6.15.0
  ├─ ajv-keywords ^3.5.2
  ├─ apache-arrow ^21.0.0 → 21.1.0
  ├─ big.js ^5.2.2
  ├─ cash-dom ^8.1.4 → 8.1.5
  ├─ cash-dom ^8.1.1 → 8.1.5
  ├─ cash-dom ^8.1.5 → 8.1.5
  ├─ convert-source-map ^2.0.0 → 2.0.0
  ├─ csstype ^3.2.2 → 3.2.3
  ├─ datagrok-api ^1.21.1 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.25.0 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.27.0 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.26.2 → 1.27.6
  ├─ dayjs ^1.11.13 → 1.11.21
  ├─ dayjs 1.11.19 → 1.11.19
  ├─ dayjs ^1.11.10 → 1.11.21
  ├─ debug ^4.1.0 → 4.4.3
  ├─ diff-grok ^1.2.0 → 1.3.1
  ├─ ebnf ^1.9.1 → 1.9.1
  ├─ emojis-list ^3.0.0 → 3.0.0
  ├─ exceljs ^4.3.0 → 4.4.0
  ├─ fast-equals ^5.2.2 → 5.4.0
  ├─ fast-sha256 ^1.3.0 → 1.3.0
  ├─ fastest-levenshtein ^1.0.12 → 1.0.16
  ├─ fflate ^0.7.4 → 0.7.4
  ├─ file-loader ^6.2.0 → 6.2.0
  ├─ gensync ^1.0.0-beta.2 → 1.0.0-beta.2
  ├─ graphology ^0.25.4
  ├─ graphology-layout-forceatlas2 ^0.10.1 → 0.10.1
  ├─ graphology-utils ^2.1.0 → 2.5.2
  ├─ html2canvas ^1.4.1 → 1.4.1
  ├─ iconv-lite ^0.6.3 → 0.6.3
  ├─ icss-utils ^5.0.0 → 5.1.0
  ├─ jaro-winkler-typescript ^1.0.1 → 1.0.1
  ├─ js-base64 ^3.7.5 → 3.7.8
  ├─ json5 ^2.1.2 → 2.2.3
  ├─ json5 ^2.2.3 → 2.2.3
  ├─ jstat ^1.9.6 → 1.9.6
  ├─ loader-utils ^2.0.0 → 2.0.4
  ├─ lodash.clonedeepwith ^4.5.0 → 4.5.0
  ├─ lodash.isequal ^4.5.0 → 4.5.0
  ├─ loose-envify ^1.1.0 → 1.4.0
  ├─ lru-cache ^10.4.3 → 10.4.3
  ├─ ml-levenberg-marquardt ^2.0.0
  ├─ ml-levenberg-marquardt ^4.1.3
  ├─ nanoid ^3.3.12 → 3.3.12
  ├─ openchemlib ^7.2.3
  ├─ picocolors ^1.1.1 → 1.1.1
  ├─ postcss-selector-parser ^7.0.0 → 7.1.2
  ├─ postcss-value-parser ^4.1.0 → 4.2.0
  ├─ react ^18.3.1 → 18.3.1
  ├─ rxjs ^6.6.7 → 6.6.7
  ├─ rxjs ^6.5.5 → 6.6.7
  ├─ schema-utils ^3.0.0 → 3.3.0
  ├─ seedrandom ^3.0.5 → 3.0.5
  ├─ semver ^6.3.1 → 6.3.1
  ├─ source-map-js ^1.2.1 → 1.2.1
  ├─ source-map-js ^1.0.2 → 1.2.1
  ├─ source-map-loader ^4.0.1 → 4.0.2
  ├─ tslib ^1.9.0 → 1.14.1
  ├─ typeahead-standalone 4.14.1 → 4.14.1
  ├─ umap-js ^1.3.3 → 1.4.0
  ├─ uuid ^10.0.0 → 10.0.0
  ├─ worker-loader ^3.0.8 → 3.0.8
  ├─ ws ^8.18.2 → 8.21.0
├─ wu ^2.1.0 → 2.1.0
  ├─ @babel/code-frame ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/compat-data ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/core ^7.27.1 → 7.29.7
  ├─ @babel/generator ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-compilation-targets ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-globals ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-module-imports ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-module-transforms ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-string-parser ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-validator-identifier ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-validator-option ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helpers ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/parser ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/template ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/traverse ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/types ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @datagrok-libraries/chem-meta ^1.0.12 → 1.2.12
  ├─ @jridgewell/gen-mapping ^0.3.12 → 0.3.13
  ├─ @jridgewell/gen-mapping ^0.3.5 → 0.3.13
  ├─ @jridgewell/remapping ^2.3.5 → 2.3.5
  ├─ @jridgewell/trace-mapping ^0.3.28 → 0.3.31
  ├─ @jridgewell/trace-mapping ^0.3.24 → 0.3.31
  ├─ @swc/helpers ^0.5.11 → 0.5.23
  ├─ @types/command-line-args ^5.2.3 → 5.2.3
  ├─ @types/command-line-usage ^5.0.4 → 5.0.4
  ├─ @types/json-schema ^7.0.8 → 7.0.15
  ├─ @types/lodash * → 4.17.24
  ├─ @types/node ^24.0.3 → 24.13.1
  ├─ @types/prop-types * → 15.7.15
  ├─ @types/react ^18.3.11 → 18.3.31
  ├─ @types/wu ^2.1.44 → 2.1.44
  ├─ @webgpu/types ^0.1.40 → 0.1.69
  ├─ ajv ^6.12.5 → 6.15.0
  ├─ ajv-keywords ^3.5.2
  ├─ apache-arrow ^21.0.0 → 21.1.0
  ├─ archiver ^5.0.0 → 5.3.2
  ├─ big.js ^5.2.2
  ├─ browserslist ^4.24.0 → 4.28.2
  ├─ cash-dom ^8.1.5 → 8.1.5
  ├─ cash-dom ^8.1.1 → 8.1.5
  ├─ command-line-args ^6.0.1 → 6.0.2
  ├─ command-line-usage ^7.0.1 → 7.0.4
  ├─ convert-source-map ^2.0.0 → 2.0.0
  ├─ cssesc ^3.0.0 → 3.0.0
  ├─ csstype ^3.2.2 → 3.2.3
  ├─ datagrok-api ^1.27.0 → 1.27.6
  ├─ datagrok-api ^1.21.1 → 1.27.6
  ├─ dayjs ^1.11.13 → 1.11.21
  ├─ dayjs ^1.11.10 → 1.11.21
  ├─ dayjs ^1.8.34 → 1.11.21
  ├─ dayjs 1.11.19 → 1.11.19
  ├─ debug ^4.3.1 → 4.4.3
  ├─ debug ^4.1.0 → 4.4.3
  ├─ emojis-list ^3.0.0 → 3.0.0
  ├─ fast-csv ^4.3.1 → 4.3.6
  ├─ fast-deep-equal ^3.1.1 → 3.1.3
  ├─ fast-json-stable-stringify ^2.0.0 → 2.1.0
  ├─ fast-sha256 ^1.3.0 → 1.3.0
  ├─ file-loader ^6.2.0 → 6.2.0
  ├─ flatbuffers ^25.1.24 → 25.9.23
  ├─ gensync ^1.0.0-beta.2 → 1.0.0-beta.2
  ├─ graphology-utils ^2.1.0 → 2.5.2
  ├─ iconv-lite ^0.6.3 → 0.6.3
  ├─ js-base64 ^3.7.5 → 3.7.8
  ├─ js-tokens ^4.0.0 → 4.0.0
  ├─ js-tokens ^3.0.0 || ^4.0.0 → 4.0.0
  ├─ jsesc ^3.0.2 → 3.0.2
  ├─ json-bignum ^0.0.3 → 0.0.3
  ├─ json-schema-traverse ^0.4.1 → 0.4.1
  ├─ json5 ^2.2.3 → 2.2.3
  ├─ json5 ^2.1.2 → 2.2.3
  ├─ jszip ^3.10.1 → 3.10.1
  ├─ loader-utils ^2.0.0 → 2.0.4
  ├─ loose-envify ^1.1.0 → 1.4.0
  ├─ lru-cache ^5.1.1 → 5.1.1
  ├─ ml-levenberg-marquardt ^2.0.0
  ├─ ml-levenberg-marquardt ^4.1.3
  ├─ ms ^2.1.3 → 2.1.3
  ├─ openchemlib ^7.2.3
  ├─ picocolors ^1.1.1 → 1.1.1
  ├─ react ^18.3.1 → 18.3.1
  ├─ readable-stream ^3.6.0 → 3.6.2
  ├─ rxjs ^6.5.5 → 6.6.7
  ├─ safer-buffer >= 2.1.2 < 3.0.0 → 2.1.2
  ├─ saxes ^5.0.1
  ├─ schema-utils ^3.0.0 → 3.3.0
  ├─ semver ^6.3.1 → 6.3.1
  ├─ source-map-js ^1.0.2 → 1.2.1
  ├─ source-map-loader ^4.0.1 → 4.0.2
  ├─ tmp ^0.2.0 → 0.2.7
  ├─ tslib ^1.9.0 → 1.14.1
  ├─ tslib ^2.6.2 → 2.8.1
  ├─ typeahead-standalone 4.14.1 → 4.14.1
  ├─ unzipper ^0.10.11 → 0.10.14
  ├─ uri-js ^4.2.2 → 4.4.1
  ├─ util-deprecate ^1.0.2 → 1.0.2
  ├─ uuid ^8.3.0 → 8.3.2
  ├─ worker-loader ^3.0.8 → 3.0.8
  ├─ ws ^8.18.2 → 8.21.0
├─ wu ^2.1.0 → 2.1.0
  ├─ @babel/code-frame ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/compat-data ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/core ^7.27.1 → 7.29.7
  ├─ @babel/generator ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-compilation-targets ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-globals ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-module-imports ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-module-transforms ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-string-parser ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-validator-identifier ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helper-validator-option ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/helpers ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/parser ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/template ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/traverse ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @babel/types ^7.29.7 → 7.29.7
  ├─ @datagrok-libraries/chem-meta ^1.0.12 → 1.2.12
  ├─ @fast-csv/format 4.3.5 → 4.3.5
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